rA                157 src/maxH_main.cpp   double rA {1.};
rA                159 src/maxH_main.cpp   double rt {(rE * rA)/( rE * exp(-k*t) + rA *( 1 - exp(-k*t)))};
rA                190 src/secOrd_op_initData_impl.cpp    rA {Parameter::getValue<double>("logistic_growth.r_start", 1.)},
rA                202 src/secOrd_op_initData_impl.cpp     lgf = rE*rA/(rE * ekt + rA * (1 - ekt));
rA                209 src/secOrd_op_initData_impl.cpp    rA {Parameter::getValue<double>("logistic_growth.r_start", 1.)},
rA                220 src/secOrd_op_initData_impl.cpp     rt = rE*rA/(rE * ekt + rA * (1. - ekt));
rA                258 src/secOrd_op_initData_impl.h       double rA;
rA                290 src/secOrd_op_initData_impl.h       double rA;
rA                 56 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp   const double rA {Parameter::getValue<double>("logistic_growth.r_start", 1.)};
rA                 63 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp   dassert(rE > rA, Assert::compose(__FILE__, __LINE__, "r_end <= r_start"));
rA                 64 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp   dassert(rA > 0, Assert::compose(__FILE__, __LINE__, "r_start < 0"));
rA                 70 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp     fun_impl = [&tp = tp, rA, k, rE]
rA                 76 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp       r = 2*k*x*y*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1)*exp(-6*t) - (k*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1))*x*y*exp(-6*t) + 4*pow(x,3)*y*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) + 4*x*pow(y,3)*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) - 6*x*y*exp(-6*t) + 2*(pow(x,3)*y*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + (pow(x,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*y*exp(-6*t) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + (4*pow(x,2)*pow(y,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(x,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*x*y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + (4*pow(x,2)*pow(y,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(y,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*x*y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(x*pow(y,3)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + x*(pow(y,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*exp(-6*t) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + 2*(2*pow(x,2)*y*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*x*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(2*x*pow(y,2)*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*y*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(2*x*y*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1);
rA                 80 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp     fun_impl = [&tp = tp, rA, k, rE, al, Dc]
rA                 86 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp       r = 2*k*y*z*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1)*exp(-6*t) - (k*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1))*y*z*exp(-6*t) - 6*y*z*exp(-6*t) + (4*pow(x,2)*pow(y,3)*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) + 4*pow(x,2)*y*pow(z,3)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) + 2*(2*pow(x,2)*y*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + 2*(2*x*pow(y,2)*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*x*y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(pow(y,3)*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + (pow(y,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*z*exp(-6*t) - y*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + 2*(2*x*y*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*x*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + (4*pow(y,2)*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(y,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*y*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + (4*pow(y,2)*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(z,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*y*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(y*pow(z,3)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + y*(pow(z,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*exp(-6*t) - y*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1))*Dc;
rA                157 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp    rA {Parameter::getValue<double>("logistic_growth.r_start", 1.)},
rA                204 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp    rA {Parameter::getValue<double>("logistic_growth.r_start", 1.)},
rA                210 src/secOrd_op_rhs_impl.cpp   return 2*k*x*y*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1)*exp(-6*t) - (k*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1) + k*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*(rA/(rA*(exp(-k*t) - 1) - rE*exp(-k*t)) + 1))*x*y*exp(-6*t) + 4*pow(x,3)*y*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) + 4*x*pow(y,3)*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),3) - 6*x*y*exp(-6*t) + 2*(pow(x,3)*y*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + (pow(x,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*y*exp(-6*t) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + (4*pow(x,2)*pow(y,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(x,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(x,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*x*y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + (4*pow(x,2)*pow(y,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - pow(y,2)*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - (pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1)*exp(-6*t))*x*y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(x*pow(y,3)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) + x*(pow(y,3)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*exp(-6*t) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(y,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1) + 2*(2*pow(x,2)*y*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - y*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*x*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(2*x*pow(y,2)*z*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*z*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*y*z/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) + 2*(2*x*y*pow(z,2)*exp(-6*t)/pow(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2),2) - x*y*exp(-6*t)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)))*(pow(z,2)/(pow(x,2) + pow(y,2) + pow(z,2)) - 1);
rA                186 src/secOrd_op_rhs_impl.h       double rA;
rA                267 src/secOrd_op_rhs_impl.h       double rA;